咸阳市食品药品检验检测中心始建于1973年4月，原名咸阳地区药品检验所，2013年11月，经咸阳市编委批准，升格为具有独立法人资格的副县级事业单位，隶属于咸阳市市场监督管理局管理，主要承担全市食品、药品、化妆品检验检测任务。
中心内设综合科、业务管理科、食品检测科、药品检测科、微生物检测科、化妆品检测科、医疗器械检测科等7个科室。自2017年以来，建成泾三淳、乾礼永、彬长旬、兴武4个区域分中心，形成全市食品药品检验检测“一干四支”机构布局，实现了食品安全监督抽检工作“五统一”，即：检验机构统一建设，抽检计划统一下达、抽检经费统一使用、抽检任务统一调配，抽检信息统一公布。该项举措被国务院食安办称之为“咸阳模式”，先后两次来咸召开全国现场会。
中心及四个区域分中心实验办公场所总面积21546平方米, 其中，市本级面积8033平方米，兴武分中心面积3388平方米，彬长旬分中心面积3384平方米，泾三淳分中心面积3384平方米，乾礼永分中心面积3357平方米，现有仪器设备1206台套，固定资产总值约3.1亿元。
中心及四个区域分中心现有工作人员280名，其中在编人员128名，聘用人员152名。包括检验检测专业技术人员共191人，其中高级职称10人，中级职称及同等能力人员118人，硕士研究生学历46人。
目前，中心取得CMA和CATL双资质认证，综合检验能力位居全省前列，达到国内先进水平。
其中，检验检测机构资质认定（CMA）：具备食品、药品、化妆品、洁净度检测等4699个参数的检验能力；农产品质量安全检测机构考核（CATL）：具备植物性食品中农药残留、动物性食品中兽药残留、真菌毒素、污染物、理化检验和非法添加物质等6大类917个参数的检验能力。2024年8月，顺利通过中国合格评定国家认可委员会CNAS实验室认可现场评审。
自2018年以来，按照咸阳市政府统一部署，全市实行市县级食品安全监督抽检“市级统管”，中心及下设的四个区域分中心全面承担起市县级食品安全监督抽检任务，以及国省级下达的食品、药品、化妆品监督抽检任务。中心坚持“科学、规范、公正、高效”的质量方针，实行5S卓越现场管理，检验业务运行高效，年检验量达到2万余批次。
陕西省乳品检验检测技术研究与应用平台、陕西省乳品检验检测省级重点实验室、咸阳市食品药品犯罪侦查检验检测实验室、陕西省食品药品检验检测技能培训基地、咸阳市食品药品检验检测技能培训中心、陕西省食品药品检验研究院化妆品评价检验中心（咸阳分中心）。
2020年12月被陕西省委、省政府授予“省级文明单位”称号。2024年4月经陕西省市场监管局批准，筹建陕西省茯茶质量检验检测中心。
近年来，中心推动检测事业从“技能型”向“科研型”转变，努力打造“产学研检”新高地。重点聚焦监管政策、检验技术、风险隐患等方面，大力开展科研创新工作。自市场监管体制改革以来，现已开展地方科技计划、市场监管系统科技计划、政策研究、标准制修订等项目20余项，切实保障食品药品安全，助力食品医药产业高质量发展。
